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NGS

토마토 유전자 정보 해독 토마토 유전체의 전체 염기서열이 모두 해독되었습니다. 이번 연구에는 한국생명공학연구원 허철구 박사팀과 서울대 최도일 교수팀 등 국내 연구진을 포함해 14개국 300여 명의 국제 공동연구로 진행되었습니다. 토마토 유전체 염기서열 분석은 국제 컨소시엄을 구성해 12개의 염색체를 참여 국가에 하나씩 나누는 방법으로 진행되었으며, 한국은 2번 염색체를 할당 받아 분석을 진행했습니다. ■ 토마토는 가지, 고추, 감자 등과 같은 가지과 식물의 연구모델식물로서 연간 세계 교역량이 10조 원에 달하는 중요한 채소작물입니다. 가지과 식물은 진화적으로 가장 종 분화가 다양하게 일어난 식물 분류군 중 하나로, 지구상에 3000개 이상의 종이 알려져 있습니다. ■ 염기서열분석 방법은 인간유전체 분석에 활용된 1세대 염기서열 .. 더보기
유전자 발현양 정확도 개선, 뉴마(NEUMA) 한국생명공학연구원 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)는 차세대 염기서열분석(NGS) 기술로 생산되는 대용량 서열 데이터로부터 유전자 발현 양을 계산할 때 정확도를 획기적으로 개선한 ‘유일매핑지역의 기대치 정규화(뉴마, NEUMA)’ 라는 새로운 분석기술을 최근 개발했습니다. NGS 방법은 유전체 서열을 짧은 시간에 수천 만 번 읽어서 결정하는 기법으로, 생산되는 데이터의 용량이 수십 기가바이트에 달해 정보 분석이 매우 어렵습니다. 특히 NGS 기술은 생명체의 유전자 발현 양을 측정하는 전사체서열기술(RNA-Seq) 분야에 많이 활용되고 있습니다. 유전자 발현 양을 계산하는 프로그램으로 최근 미국에서 개발된 Cufflinks나 TopHat 등이 널리 사용되고 있습니다. 연구팀이 이번에 개발한 ‘뉴마(NEU.. 더보기